عنوان مقاله:

نویسندگان:

صفیه ریگی شایسته، علی ابراهیمی، آسیه شهرکی

شیمی محاسباتی نقش ارزشمندی در کشف و توسعه داروها دارد. هزینه های هنگفت و زمان بر بودن فرایندهای طراحی دارو از چالش های اصلی این حوزه به شمار می-رود. شیمی محاسباتی با استفاده از ابزارها و تکنیک های قابل قبول توانسته نقش مهمی در این زمینه ایفا کند که هم در تحقیقات دانشگاهی و هم در شرکت های بزرگ داروسازی دنیا به طور گسترده مورد استفاده قرار می گیرد. یکی از ابزارهای معمول شیمی محاسباتی در فرآیند طراحی دارو، تکنیک داکینگ مولکولی، روشی برای پیش بینی تمایل اتصال یک مولکول به مولکول دیگر، برای تشکیل یک کمپلکس پایدار است. محاسبات داکینگ مولکولی در فرایندهای بیولوژیکی می تواند برای بررسی سه نوع اتصال، پروتئین-پروتئین، DNA-پروتئین، پروتئین-لیگاند، استفاده شود. داکینگ پروتئین-لیگاند بیشترین کاربرد را برای پیش بینی فعالیت های بیولوژیکی لیگاند و برهمکنش های آن با پروتئین دارد. در این کار، روش های محاسباتی برای مهار پروتئاز اصلی کروناویرروس (SARS-CoV-2)، عامل بیماری کووید-19، به کار گرفته شده اند. بدین منظور، کتابخانه ای از ترکیبات طبیعی طراحی شده و فعالیت آنها در مقابل پروتئین هدف مورد بررسی قرار گرفته است. شیمی فرآورده های طبیعی نه تنها مبنای علمی استفاده سنتی از گیاهان دارویی را تشکیل داده است، بلکه نقش مهمی در فرایند کشف دارو ایفا می کند.

پروتئاز اصلی کروناویروس، داکینگ مولکولی، ترکیبات طبیعی

برای لینک‌دهی به این مقاله از آدرس زیر استفاده نمایید:

برای ارجاع در منابع از عبارت زیر استفاده کنید:
ریگی شایسته، صفیه، ابراهیمی، علی، شهرکی، آسیه، 1403، بررسی نظری تمایل اتصال دسته ای از ترکیبات طبیعی پلی فنولی به پروتئاز اصلی کروناویروس، بيست و چهارمين كنفرانس شيمي فيزيك ايران (انجمن شيمي ايران)، https://conf.ui.ac.ir/fa/archive_index.php?c=HN-ipcc24&aid=1510059